HEROES／ヒーローズ　シーズン２

ヒーローたちが宿敵サイラーと壮絶な決戦を繰り広げ、ニューヨークを壊滅の危機から救って4ヶ月。

中米ホンジュラス。
マヤとアレハンドロという双子の姉妹が、マヤがかかった謎の病を治療するため、アメリカへの密入国を企てる。だがマヤの怪病はは、ある種の超能力だった。

同じ頃、エジプトのカイロの大学で、モヒンダーは超能力者から命を奪うウィルスの講義を行なっていたが、ボブと名乗る謎の男に、ベネットやリンダーマンが所属していた“組織”のために働かないかと誘われる。

カリフォルニアのコスタ・ヴェルデでは、ベネット一家が「バトラー」と名前を変えて新生活を送っていた。クレアは新しい高校に転校するが、そこで出会うウエストという青年は何故かクレアに異常な興味を示していた・・・・。

ニューヨーク。
ニューヨーク市警に転職したマットは刑事になり、サイラーに両親を殺させた少女モリーを引取っていた。やがてモリーは悪夢に悩まされるようになる。

同じニューヨーク。弟ピーターを失ったネイサンは、政治活動から足を洗いアルコールに溺れる日々を送っている。やがて不思議な幻覚を見るようになる。果たしてピーターの身に何が起きたのか・・・。

ニキとマイカの母子は、親戚が住むニューオリンズに向かう。そしてサイラーも、ある以外な場所で生き延びていた・・・。

336年前の京都の郊外にタイムスリップしてしまったヒロは、そこで自分のヒーロー、タケゾウ・ケンセイと出会って感激。だが、憧れのケンセイの正体は、予想を裏切るものだった。また、ヒロは美しい女性ヤエコと出会い、彼女に恋心を抱くように。一方ヒロの親友アンドウは、まだニューヨークに残りヒロの安否を気遣っていた・・・。

人類に再び危機が迫る中、世界各地に散ったヒーローたちは、再び1つになるか・・・！？